Pagrindinė tarša ŠESD susidaro iš biologiškai skaidžių atliekų, kurios yra šalinamos sąvartynuose. Šiuo metu keliuose Lietuvoje didžiųjų miestų sąvartynuose yra įrengta arba įrenginėjamos biodujų surinkimo sistemos, kuriose išgauta energija bus panaudota aprūpinimui šiluma. Kituose Lietuvos sąvartynuose dujų surinkimo sistemos yra įrengiamos arba bus įrengtos kai bus pasiekti projektuose numatyti atliekų kiekiai. Valstybiniame strateginiame atliekų tvarkymo plane numatyta skatinti biologiškai skaidžių atliekų tvarkymą, kai išgaunama energija arba išgaunamos maistinės medžiagos.
Nacionalinėje energetikos strategijoje (Žin. 2007, Nr. 11-430) yra numatyta komunalinių ir kitų degių atliekų panaudojimas šilumai ir elektrai gaminti - iki 2010 m. Vilniuje planuojama įrengti komunalinių atliekų deginimo įrenginį, kasmet sudeginantį apie 200 tūkst. tonų šių atliekų. Tačiau pagal vykstančias Poveikio aplinkai derinimo procedūras matyti, kad toks įrenginys Vilniuje bus pastatytas ne anksčiau kaip 2012 m. 2010–2025 m. laikotarpiu panašius įrenginius pastatyti Kaune, Klaipėdoje, Šiauliuose ir Panevėžyje.