Pagrindiniai Lietuvos Respublikos įstatymai, reglamentuojantys žemės ūkio veiklą yra Žemės ūkio ir kaimo plėtros įstatymas (Žin., 2008, Nr. 81-3174), Žemės įstatymas (Žin., 2004, Nr. 28-868), Žuvininkystės įstatymas (Žin., 2004, Nr. 73-2527), Gyvulių veislininkystės įstatymas (Žin., 1998, Nr. 110-3023), Augalų sėklininkystės įstatymas (Žin., 2004, Nr. 156-5687).
Parengtoje Nacionalinėje 2007-2013 m. kaimo plėtros strategijoje didelis dėmesys yra skiriamas aplinkos apsaugai, klimato kaitos poveikio mažinimui, bioįvairovės palaikymui, verslo plėtrai kaime ir kt. Pagal parengtą kaimo plėtros strategiją yra parengta ir įgyvendinama 2007-2013 m. kaimo plėtros programa.
Lietuvos kaimo plėtros 2007-2013 m. programoje, kurios tikslas - gerinti gyvenimo kokybę kaimo vietovėse didinant užimtumą kaimo vietovėse, remiant perėjimą iš žemės ūkio veiklos į ne žemės ūkio veiklą, skatinant pagrindinių paslaugų kaimo gyventojams ir amatų plėtrą, numatyta Europos Žemės ūkio fondo kaimo plėtrai (toliau - EŽŪFKP) finansinė parama pagal šias kryptis: žemės ūkio ir miškininkystės sektoriaus konkurencingumo didinimas, aplinkos ir kraštovaizdžio gerinimas, gyvenimo kokybės gerinimas ir kt. priemonės. Skirta 7,8 mlrd. Lt. Pirmajai krypčiai, kuri apima Nitratų direktyvos įgyvendinimą, miškų ekonominės vertės didinimą skirta 3,2 mlrd. Lt. Antrajai krypčiai, kuriai priskiriamos ekologinio ūkininkavimo, žemės apželdinimas mišku, rizikos vandenų telkinių būklės gerinimas skirta 2,8 mlrd. Lt.
Žemės ūkyje taikomos šios paramos schemos:
-
-
-
-
-
-
-
-
-
Paskutinės trys priemonės iš esmės yra veiklą žemės ūkyje ribojančios priemonės. Toliau aptariamos priemonės, įtakojančios kiekvieną iš išmetamųjų teršalų šaltinių, bei remiamos pagal aukščiau išvardintas paramos schemas.