Άρθρο 3, παραγ. 5 α)
Στο άρθρο δεν αναφέρεται αυτό που ισχύει σύμφωνα με τον Ν. 2742/1999, ότι η κατάρτιση και ευθύνη εφαρμογής των σχεδίων διαχείρισης ανήκει στην αρμοδιότητα των Φορέων Διαχείρισης.

Γενικότερα εντός του νομοσχεδίου δεν αναφέρεται ο ρόλος των Φορέων Διαχείρισης, οι οποίοι θα πρέπει να έχουν μία συνέχεια και μετά το πέρας των χρηματοδοτήσεών τους. Τα Σχέδια Διαχείρισης δεν θα πρέπει να ανατίθενται σε εξωτερικούς μελετητές αφού το προσωπικό των Φορέων Διαχείρισης και ιδιαίτερα το επιστημονικό προσωπικό γνωρίζει καλύτερα από κάθε άλλο μελετητή, επισκέπτη της περιοχής για ορισμένο διάστημα, την περιοχή και τις ανάγκες της. Για όσες από τις περιοχές δεν υπάρχουν Φορείς Διαχείρισης τα Σχέδια Διαχείρισης μπορούν να καταρτίζονται από κεντρικές υπηρεσίες του Υπουργείου. Mε τον τρόπο αυτό εξάλλου θα υπάρξει εξοικονόμηση πόρων.